醫院污水經化糞池腐化處理后進入污水處理站格柵井。經格柵清除懸浮物、藥棉、紗布及糞便雜物后進入污水調節池。

調節池為鋼砼結構，池內設預曝氣裝置。為防止污泥沉積，增加污水中的溶氧，采用微孔曝氣方式。曝氣后污水用無堵塞潛污泵提升進入豎流式一沉池。

豎流式一沉池底部污泥（含水率95%）用氣提送入污泥消化池進行好氧消化處理，其上清液重力流入生物接觸氧化池進行生化處理。

生物接觸氧化池采用推流式。池內設半軟性填料，易結膜，不堵塞，不結球。用風機鼓風供氧 。

接觸氧化技術是利用微生物群體附著在纖維填料的表面形成生物膜，在好氧條件下，廢水流經濾料表面，廢水中的有機物通過微生物的吸附、氧化、還原、合成過程，把廢水中的有機物氧化成無機物二氧化碳和水。主要設備為維系好氧生物細菌的半軟性填料及布氣充氧系統。

二沉池采用豎流斜管式。二沉池底部污泥用氣提法送入污泥消化池進行好氧消化處理，其上清液進入消毒池。

消毒池加入固體氯片（或次氯酸鈉溶液）進行消毒滅菌處理。

一沉池和二沉池的污泥均采用污泥消化池進行好氧消化處理。好氧消化處理的原理是將污泥通過混合、曝氣，達到自身氧化期，即內源呼吸期。經過內源呼吸期，使污泥中僅存在無機非分解物質，使污泥趨向穩定狀態。好氧消化目的是減少污泥量。大部分污泥經過好氧消化轉換成揮發性物質CO2、NH3、H2等。

污泥經好氧消化，加藥消毒滅菌處理后，外運處置，污水經消毒處理后達標排放。